L’internationalisation est une priorité stratégique de VetAgro Sup. Fort des acquis des Écoles fondatrices, le grand établissement se positionne dans une dynamique internationale volontaire.

VetAgro Sup met en place et participe à un grand nombre de programmes Européens de formation, cours intensifs ou formations internationales de type Master. Une nouvelle Charte Erasmus, qui accrédite la participation au programme européen de mobilité Erasmus a été attribuée à VetAgro Sup en mars 2010. VetAgro Sup participe actuellement à deux programmes Erasmus Mundus: «Master Food Identity» et «Master BioHealth Computing», et au projet Erasmus Curricula development  «GAVA Governance for sustainable development ».

VetAgro Sup est présent dans les programmes concertés bilatéraux mis en place par le Ministère de l'Agriculture, de l'Alimentation, de la Pêche, de la Ruralité et de l'Aménagement du Territoire avec des gouvernements de pays d’Amérique Latine. Ainsi un programme d’échanges avec le Chili se déroule depuis 2009 pour la formation ingénieur et deux programmes ont été mis en place en 2011 pour des échanges avec le Brésil, un dans le domaine de la médecine vétérinaire et un autre pour la formation ingénieurs.

La mobilité internationale occupe une place importante dans la formation des ingénieurs et des vétérinaires à VetAgro Sup. Une période minimum de séjour à l’étranger de deux mois est obligatoire pour l’obtention du diplôme d’ingénieur et un stage de deux semaines minimum à l’étranger est indispensable pour la formation en médecine vétérinaire. Des bourses de mobilité sont accordées chaque année par le Ministère de l'Agriculture, par les Conseils régionaux des Régions Rhône Alpes et Auvergne, par la Ville de Clermont-Ferrand, et par le programme européen Erasmus. Plus de 30% des élèves-ingénieurs de VetAgro Sup effectuent au moins un semestre d'études à l'étranger.

Dans le cadre d’accords bilatéraux d'échanges, dont nombreux dans le programme européen Erasmus, des étudiants d'universités partenaires autour du monde effectuent un à deux semestres d’études à VetAgro Sup, en formation initiale vétérinaire ou agronomique. Un nombre important d’étudiants internationaux sont accueillis en stages en clinique sur le campus vétérinaire. Des cours dispensés en langue anglaise sont mis en place et accroissent l'attractivité internationale de VetAgro Sup.

VetAgro Sup développe également des échanges internationaux dans le recherche, l'expertise et le transfert de compétences.